| 1. Identificação | ||||
| Tipo de Referência | Artigo em Evento (Conference Proceedings) | |||
| Site | sibgrapi.sid.inpe.br | |||
| Código do Detentor | ibi 8JMKD3MGPEW34M/46T9EHH | |||
| Identificador | 8JMKD3MGPEW34M/4395EF2 | |||
| Repositório | sid.inpe.br/sibgrapi/2020/09.15.23.42 | |||
| Última Atualização | 2020:09.15.23.42.37 (UTC) administrator | |||
| Repositório de Metadados | sid.inpe.br/sibgrapi/2020/09.15.23.42.37 | |||
| Última Atualização dos Metadados | 2022:06.14.00.00.04 (UTC) administrator | |||
| DOI | 10.1109/SIBGRAPI51738.2020.00049 | |||
| Chave de Citação | OliveiraPedrDias:2020:FuBLEn | |||
| Título | Fusion of BLAST and Ensemble of Classifiers for Protein Secondary Structure Prediction  | |||
| Formato | On-line | |||
| Ano | 2020 | |||
| Data de Acesso | 17 maio 2024 | |||
| Número de Arquivos | 1 | |||
| Tamanho | 218 KiB | |||
| 2. Contextualização | ||||
| Autor | 1 Oliveira, Gabriel Bianchin de 2 Pedrini, Helio 3 Dias, Zanoni | |||
| Afiliação | 1 Institute of Computing, University of Campinas, Campinas, SP, Brazil, 13083-852 2 Institute of Computing, University of Campinas, Campinas, SP, Brazil, 13083-852 3 Institute of Computing, University of Campinas, Campinas, SP, Brazil, 13083-852 | |||
| Editor | Musse, Soraia Raupp Cesar Junior, Roberto Marcondes Pelechano, Nuria Wang, Zhangyang (Atlas) | |||
| Endereço de e-Mail | helio@ic.unicamp.br | |||
| Nome do Evento | Conference on Graphics, Patterns and Images, 33 (SIBGRAPI) | |||
| Localização do Evento | Porto de Galinhas (virtual) | |||
| Data | 7-10 Nov. 2020 | |||
| Editora (Publisher) | IEEE Computer Society | |||
| Cidade da Editora | Los Alamitos | |||
| Título do Livro | Proceedings | |||
| Tipo Terciário | Full Paper | |||
| Histórico (UTC) | 2020-09-15 23:42:37 :: helio@ic.unicamp.br -> administrator :: 2022-06-14 00:00:04 :: administrator -> helio@ic.unicamp.br :: 2020 | |||
| 3. Conteúdo e estrutura | ||||
| É a matriz ou uma cópia? | é a matriz | |||
| Estágio do Conteúdo | concluido | |||
| Transferível | 1 | |||
| Tipo de Versão | finaldraft | |||
| Palavras-Chave | Protein Structure Prediction Classifier Ensemble Amino Acid Sequence | |||
| Resumo | The prediction of protein secondary structure has great relevance in the analysis of global protein folding. In this work, we present a method for protein secondary structure prediction using the fusion of BLAST and the ensemble of local and global classifiers. We used the amino acid sequence and sequence similarity information available in the datasets and we explored other amino acid characteristics. In order to evaluate our method, we used the files from PDB (only from the year 2018), as well as CB6133 and CB513 datasets. We achieved 87.7%, 82.4% and 85.6% Q8 accuracy on PDB 2018, CB6133 and CB513 proteins using the amino acid sequence and amino acid biological properties, 84.7% and 87.5% Q8 accuracy on CB6133 and CB513 proteins using the amino acid sequence and similarity sequence information and 92.5% Q3 accuracy on PDB 2018 proteins using the amino acid sequence and amino acid biological properties. Our method presented competitive results using only BLAST and only the ensemble of classifiers. The fusion of both approaches achieved superior results compared to state-of-the-art approaches. | |||
| Arranjo 1 | urlib.net > SDLA > Fonds > SIBGRAPI 2020 > Fusion of BLAST... | |||
| Arranjo 2 | urlib.net > SDLA > Fonds > Full Index > Fusion of BLAST... | |||
| Conteúdo da Pasta doc | acessar | |||
| Conteúdo da Pasta source | não têm arquivos | |||
| Conteúdo da Pasta agreement |
| |||
| 4. Condições de acesso e uso | ||||
| URL dos dados | http://urlib.net/ibi/8JMKD3MGPEW34M/4395EF2 | |||
| URL dos dados zipados | http://urlib.net/zip/8JMKD3MGPEW34M/4395EF2 | |||
| Idioma | en | |||
| Arquivo Alvo | PID6614063.pdf | |||
| Grupo de Usuários | helio@ic.unicamp.br | |||
| Visibilidade | shown | |||
| Permissão de Atualização | não transferida | |||
| 5. Fontes relacionadas | ||||
| Repositório Espelho | sid.inpe.br/banon/2001/03.30.15.38.24 | |||
| Unidades Imediatamente Superiores | 8JMKD3MGPEW34M/43G4L9S 8JMKD3MGPEW34M/4742MCS | |||
| Lista de Itens Citando | sid.inpe.br/sibgrapi/2020/10.28.20.46 6 sid.inpe.br/banon/2001/03.30.15.38.24 2 | |||
| Acervo Hospedeiro | sid.inpe.br/banon/2001/03.30.15.38 | |||
| 6. Notas | ||||
| Campos Vazios | archivingpolicy archivist area callnumber contenttype copyholder copyright creatorhistory descriptionlevel dissemination edition electronicmailaddress group isbn issn label lineage mark nextedition notes numberofvolumes orcid organization pages parameterlist parentrepositories previousedition previouslowerunit progress project readergroup readpermission resumeid rightsholder schedulinginformation secondarydate secondarykey secondarymark secondarytype serieseditor session shorttitle sponsor subject tertiarymark type url volume | |||
| 7. Controle da descrição | ||||
| e-Mail (login) | helio@ic.unicamp.br | |||
| atualizar | ||||